Лаборатория статистической физики конденсированных сред (зав. лаб. Нефедев Константин Валентинович)
Лаборатория суперкомпьютерных и квантовых вычислений (зав. лаб. Шевченко Юрий Андреевич)
Лаборатория теоретической и ядерной физики (зав. лаб. Разов Валерий Иванович)
Лаборатория интеллектуальных технологий (зав. лаб. Солдатов Константин Сергеевич)
Лаборатория моделирования физических процессов (зав. лаб. Афремов Леонид Лазаревич)
Лаборатория вычислительной физики (зав.лаб. Ильюшин Илья Геннадьевич)