Отделение машиностроения, морской техники и транспорта создано в структуре Инженерного департамента в результате преобразования Инженерной школы в Политехнический институт ДВФУ в 2020 г.
Отделение образовано путем объединения 3 кафедр:
Кафедра транспортных машин и транспортно-технологических процессов;
Кафедра судовой энергетики и автоматики;